شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)

author

Abstract:

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به طوری که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می‌کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونه‌های زراعی و وحشی گندم استفاده شد. بذور در گلدان های پلاستیکی کشت شدند و در مرحله دو تا سه برگی DNA به روش دویل و همکاران (1990) استخراج گردید. PCR با یک جفت پرایمر اختصاصی تکثیر و محصولاتPCR خالص سازی و توالی یابی شدند . نتایج، تنوع نوکلئوتیدی بین گونه‌های مورد بررسی و گندم نان موجود در NCBI را نشان داد. نتایج توالی‌یابی در سطح DNA نشان داد که گونه آژیلوپس اسپلتوئیدس با 9/98 درصد، بیشترین شباهت و نمونه‌های گندم وحشی آژیلوپس کوداتا و آژیلوپس تریانسیالیس با 9/93 درصد کمترین شباهت را در مقایسه با گندم نان NCBI نشان می دهند، در حالی که هوردئوم اسپونتانئوم تنها 5/36 درصد، کمترین شباهت را با توالی NCBI نشان داد. درخت‌های فیلوژنتیکی که در سطح DNA با روش UPGMA ترسیم شدند نتایج بالا را تایید نمود. همچنین روش‌های فیلوژنتیکی DNA نشان می‌دهد که Ae. speltoides و گندم نان در یک زیر گروه قرار گرفته‌اند که نشان دهنده این است که ژن HKT از Ae. speltoides به واسطه الحاق وارد گندم نان شده است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (hkt)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می باشد، به طوری که سالانه میلیون ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک های زراعی می شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح dna و rna را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن hkt از گونه های زراعی و و...

full text

مطالعه ی ملکولی و آنالیز توالی ژن موثر در تحمل به شوری(hkt) درگونه های وحشی و زراعی گندم

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می باشد به طوری که سالانه میلیون ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک های زراعی می شود. تحقیقات نشان داده است که تنش های غیر زنده از جمله تنش شوری عملکرد گیاهان زراعی را 50 درصد و در گندم تا 80 درصد کاهش می دهند. گندم اولین غله و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان و یک پنجم کالری مورد نیاز بشر را تأمین می کند. محدودیت منابع...

15 صفحه اول

بررسی روابط فیلوژنتیکی ژن های واکسی در گندم های وحشی و زراعی با استفاده از pcr چندگانه

پروتئین های واکسی مسئول سنتز آمیلوز در دانه های گندم می باشند که در گندم های هگزاپلوئید به وسیله  سه ژن واکسی wx- a1 wx-b1, و wx-d1 رمزگذاری می­شوند که نقش مهمی در کیفیت آرد گندم دارند. هدف این مطالعه بررسی روابط فیلوژنتیکی ژن های واکسی در گندم های وحشی و زراعی با استفاده از pcr چندگانه می باشد. برای این منظور 71 جمعیت از 8 گونه جنس آژیلوپس و 4 گونه گندم وحشی با استفاده ازتکنیک pcr چندگانه مورد...

full text

شناسایی مولکولی cochliobolus sativusعامل بیماری لکه سوختگی گندم با استفاده از توالی یابی its ریبوزومی و بررسی روابط فیلوژنتیکی گونه های موجود در جنس cochliobolus

عامل بیماری لکه سوختگی گندم قارچcochliobolus sativus است که در بسیاری از مناطق جهان به عنوان یکی از مهم ترین بیماری های گندم مطرح است. از مناطق آلوده شمال کشور نمونه های مشکوک به این بیماری جمع آوری و از میان آن ها هشت جدایه عامل بیماری به عنوان نماینده انتخاب و مورد بررسی مورفولوژیکی، اثبات بیماریزایی و مولکولی قرار گرفتند. مشخصات مورفولوژیکی جدایه ها با استفاده از کلیدهای معتبر نشان داد که عل...

full text

ارزیابی روابط فیلوژنتیکی گونه ‏های Trichoderma به دست آمده از شالیزارهای استان مازندران بر اساس توالی‏های ژن tef1α

جنس Trichodermaاز مهم‏ترین جنس‏های قارچی در زمینه کنترل بیولوژیک بیماری‏های گیاهی، افزایش رشد و القای مقاومت در گیاهان به شمار می‏رود. ارتباط فیلوژنتیکی 81 جدایه‏ متعلق به شش گونه از این جنس (شامل چند جدایه بیوکنترل امید بخش) که از مزارع برنج استان مازندران به دست آمده‏اند، بر اساس توالی قطعه‏ای از ژن αtef1بررسی شد. توالی‏های‏ ژن مذکور در جدایه‏های مورد آزمایش به همراه توالی‏ه...

full text

مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها

سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 21  issue 3

pages  153- 169

publication date 2014-11-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023